Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd12P23812 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms