Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms