Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnnc1P19123 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms