Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18525 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18525 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18525 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18525 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18525 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18525 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18525 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms