Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gabra6P16305 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gabra6P16305 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra6P16305 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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