Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms