Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms