Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PtprqP0C5E4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PtprqP0C5E4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprqP0C5E4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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