Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LtaP09225 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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