Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Itgb1P09055 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb1P09055 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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