Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb7P09024 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms