Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgamP05555 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms