Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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