Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01649 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01649 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms