Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01648 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01648 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01648 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01648 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01648 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01648 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01648 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01648 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms