Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TsksO54887 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsksO54887 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsksO54887 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms