Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DffaO54786 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DffaO54786 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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DffaO54786 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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DffaO54786 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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DffaO54786 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DffaO54786 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DffaO54786 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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