Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms