Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cited2O35740 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms