Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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