Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LfngO09010 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LfngO09010 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LfngO09010 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LfngO09010 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LfngO09010 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LfngO09010 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms