Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcshO08795 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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