Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MttpO08601 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms