Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec22bO08547 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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