Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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