Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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