Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2035J3QP87 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms