Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Top6blJ3QMY9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top6blJ3QMY9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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