Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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