Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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