Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn20G5E8X0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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