Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sez6l-203ENSMUST00000197425 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Auts2-217ENSMUST00000187544 3166 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms