Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Rdh16f1E9Q9P8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Rdh16f1E9Q9P8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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