Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm20518E9Q548 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20518E9Q548 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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