Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9972E9Q053 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9972E9Q053 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms