Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gcn1E9PVA8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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