Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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