Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf217D3YYI7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf217D3YYI7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms