Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce3B5KM66 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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