Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cspp1B2RX88 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspp1B2RX88 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms