Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprbB2RU80 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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