Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uhrf1bp1B2KF50 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms