Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll13A4Q9F6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms