Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6880A3KG45 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms