Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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