Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms