Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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