Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Speer3W4VSP1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms