Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd2V9GX34 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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