Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac6Q9Z2V5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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